Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBEC3HQ6NTF7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms