Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDE2Q6IQ49 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms