Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USPL1Q5W0Q7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms