Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GARNL3Q5VVW2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GARNL3Q5VVW2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms