Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CC2D1BQ5T0F9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CC2D1BQ5T0F9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms