Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A3Q5K4L6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms