Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms