Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALFQ53S48 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALFQ53S48 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms