Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC184Q52MB2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC184Q52MB2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms