Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SP6Q3SY56 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms