Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCGF3Q3KNV8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCGF3Q3KNV8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms