Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MSMPQ1L6U9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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