Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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