Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDO1Q16878 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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