Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX1AQ16623 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX1AQ16623 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms