Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC6Q16204 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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