Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8Q15843 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NEDD8Q15843 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8Q15843 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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