Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITSN1Q15811 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITSN1Q15811 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
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