Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SS18Q15532 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SS18Q15532 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18Q15532 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SS18Q15532 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SS18Q15532 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18Q15532 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SS18Q15532 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SS18Q15532 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18Q15532 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SS18Q15532 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18Q15532 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18Q15532 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18Q15532 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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