Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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RABEP1Q15276 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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RABEP1Q15276 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABEP1Q15276 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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