Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRKQ15262 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRKQ15262 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRKQ15262 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
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