Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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TRAM2Q15035 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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TRAM2Q15035 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM2Q15035 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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