Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPD2Q15021 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPD2Q15021 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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