Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPHQ15003 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCAPHQ15003 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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