Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPNMBQ14956 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPNMBQ14956 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms