Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARB2Q14108 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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