Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGB1Q14028 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGB1Q14028 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CNGB1Q14028 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CNGB1Q14028 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNGB1Q14028 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
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