Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EXOSC2Q13868 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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