Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CDH18Q13634 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CDH18Q13634 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH18Q13634 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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