Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD4Q13485 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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