Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNTA1Q13424 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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