Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE3BQ13370 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
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