Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF1Q13351 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF1Q13351 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF1Q13351 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF1Q13351 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLF1Q13351 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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