Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTK7Q13308 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms