Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.585e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC38A1-209ENST00000551506 586 ntTSL 318.08■□□□□ 0.486e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CCDC22-203ENST00000496651 809 ntTSL 317.87■□□□□ 0.455e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 517.73■□□□□ 0.435e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.324e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PSMA1-206ENST00000528018 479 ntTSL 216.92■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 DNAJB4-205ENST00000484662 906 ntTSL 216.31■□□□□ 0.25e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 IL11RA-214ENST00000557298 1505 ntTSL 515.94■□□□□ 0.145e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MOB1A-202ENST00000463975 1799 ntTSL 215.55■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 415.52■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MOB1A-203ENST00000488006 482 ntTSL 315.08■□□□□ 05e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.015e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 TPCN1-203ENST00000428632 2296 ntTSL 214.84□□□□□ -0.035e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.035e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 214.59□□□□□ -0.075e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CSNK2A1-205ENST00000460062 552 ntTSL 414.59□□□□□ -0.075e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CSNK2A1-206ENST00000608066 577 ntTSL 414.59□□□□□ -0.075e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 TPCN1-220ENST00000552542 828 ntTSL 514.01□□□□□ -0.175e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 AURKA-211ENST00000441357 991 ntTSL 314□□□□□ -0.175e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.25e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.275e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.295e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MOB1A-206ENST00000497054 784 ntTSL 213.08□□□□□ -0.325e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CCDC22-202ENST00000490300 741 ntTSL 312.98□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.475e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.475e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.515e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.526e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 LINC01667-201ENST00000623554 1137 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.565e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.585e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.636e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-205ENST00000585592 622 ntTSL 210.92□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ANTXR2-206ENST00000482406 932 ntTSL 410.76□□□□□ -0.695e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.755e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC38A1-210ENST00000552197 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.786e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-204ENST00000538170 4093 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.795e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ZBTB40-203ENST00000400239 1855 ntTSL 510.02□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-209ENST00000588910 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.825e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 AL117329.1-202ENST00000426452 642 ntTSL 49.55□□□□□ -0.885e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.915e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.955e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.015e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 GIPC2-202ENST00000476882 312 ntTSL 38.4□□□□□ -1.065e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.095e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 OSBPL9-220ENST00000531061 530 ntTSL 48.15□□□□□ -1.15e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 DNAJB4-206ENST00000487931 949 ntTSL 28.11□□□□□ -1.115e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 OSBPL9-224ENST00000533825 565 ntTSL 47.33□□□□□ -1.245e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.285e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.35e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.315e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 AL390334.1-204ENST00000556890 578 ntTSL 1 (best)6.74□□□□□ -1.334e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 DNAJB4-202ENST00000426517 686 ntTSL 36.7□□□□□ -1.345e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 AL390334.1-203ENST00000554904 569 ntTSL 46.6□□□□□ -1.354e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.365e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-206ENST00000587359 584 ntTSL 56.5□□□□□ -1.375e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-208ENST00000588349 543 ntTSL 56.42□□□□□ -1.385e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.395e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 AL390334.1-202ENST00000553392 674 ntTSL 36.18□□□□□ -1.424e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.465e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 DENND1A-208ENST00000475421 537 ntTSL 25.92□□□□□ -1.465e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.475e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MOB1A-205ENST00000495286 741 ntTSL 35.8□□□□□ -1.485e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.495e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PDK1-204ENST00000416991 699 ntTSL 55.54□□□□□ -1.525e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.555e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 MAPRE2-210ENST00000589180 553 ntTSL 55.26□□□□□ -1.575e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 SLC16A1-AS1-201ENST00000413231 377 ntTSL 25.24□□□□□ -1.575e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 CSNK2A1-208ENST00000609525 581 ntTSL 55.12□□□□□ -1.595e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 IL23R-204ENST00000473881 1507 ntTSL 1 (best)5.09□□□□□ -1.595e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.615e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.625e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 OSBPL9-221ENST00000531819 4520 ntTSL 24.87□□□□□ -1.635e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 DNAJB4-204ENST00000477671 737 ntTSL 53.98□□□□□ -1.775e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.915e-7■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ARIH2-204ENST00000433170 560 ntTSL 419.94■□□□□ 0.784e-17■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ARIH2-206ENST00000449729 678 ntTSL 216.04■□□□□ 0.164e-17■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 ARIH2-213ENST00000466850 546 ntTSL 211.76□□□□□ -0.534e-17■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.372e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PRELID2-209ENST00000515475 582 ntTSL 427.41■■□□□ 1.982e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 527.35■■□□□ 1.972e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.452e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 KTN1-221ENST00000555498 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.48■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 22.7
TARDBPQ13148 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 22.7
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