Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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