Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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