Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3C1Q12789 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms