Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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