Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 UBR2YLR024C 5619 nt2.54□□□□□ -2
TSR3Q12094 PSD2YGR170W 3417 nt2.53□□□□□ -2
TSR3Q12094 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt2.5□□□□□ -2.01
TSR3Q12094 SBH2YER019C-A 267 nt2.49□□□□□ -2.01
TSR3Q12094 SPP41YDR464W 4308 nt2.46□□□□□ -2.02
TSR3Q12094 LAA1YJL207C 6045 nt2.44□□□□□ -2.02
TSR3Q12094 IRA2YOL081W 9240 nt2.43□□□□□ -2.02
TSR3Q12094 SSK2YNR031C 4740 nt2.43□□□□□ -2.02
TSR3Q12094 VAM6YDL077C 3150 nt2.42□□□□□ -2.02
TSR3Q12094 YPR117WYPR117W 7470 nt2.41□□□□□ -2.02
TSR3Q12094 NUP170YBL079W 4509 nt2.39□□□□□ -2.03
TSR3Q12094 CSF1YLR087C 8877 nt2.38□□□□□ -2.03
TSR3Q12094 TRM732YMR259C 4263 nt2.31□□□□□ -2.04
TSR3Q12094 MON2YNL297C 4911 nt2.3□□□□□ -2.04
TSR3Q12094 YOR093CYOR093C 4947 nt2.28□□□□□ -2.04
TSR3Q12094 BNI1YNL271C 5862 nt2.25□□□□□ -2.05
TSR3Q12094 CDC39YCR093W 6327 nt2.24□□□□□ -2.05
TSR3Q12094 BPH1YCR032W 6504 nt2.22□□□□□ -2.05
TSR3Q12094 YOL014WYOL014W 375 nt2.22□□□□□ -2.05
TSR3Q12094 SEC16YPL085W 6588 nt2.21□□□□□ -2.05
TSR3Q12094 USO1YDL058W 5373 nt2.2□□□□□ -2.06
TSR3Q12094 TOR2YKL203C 7425 nt2.19□□□□□ -2.06
TSR3Q12094 RPL41BYDL133C-A 78 nt2.19□□□□□ -2.06
TSR3Q12094 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.15□□□□□ -2.07
TSR3Q12094 PMD1YER132C 5262 nt2.12□□□□□ -2.07
TSR3Q12094 YMR045CYMR045C 5268 nt2.12□□□□□ -2.07
TSR3Q12094 YJL113WYJL113W 4647 nt2.11□□□□□ -2.07
TSR3Q12094 FKS1YLR342W 5631 nt2.11□□□□□ -2.07
TSR3Q12094 LTE1YAL024C 4308 nt2.1□□□□□ -2.07
TSR3Q12094 PEP1YBL017C 4740 nt2.09□□□□□ -2.07
TSR3Q12094 YJR029WYJR029W 5268 nt2.08□□□□□ -2.08
TSR3Q12094 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt2.06□□□□□ -2.08
TSR3Q12094 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt2.06□□□□□ -2.08
TSR3Q12094 BUD3YCL014W 4911 nt2.05□□□□□ -2.08
TSR3Q12094 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.03□□□□□ -2.08
TSR3Q12094 TMA7YLR262C-A 195 nt1.99□□□□□ -2.09
TSR3Q12094 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.99□□□□□ -2.09
TSR3Q12094 snR58snR58 96 nt1.95□□□□□ -2.1
TSR3Q12094 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.94□□□□□ -2.1
TSR3Q12094 HKR1YDR420W 5409 nt1.92□□□□□ -2.1
TSR3Q12094 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.91□□□□□ -2.1
TSR3Q12094 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.88□□□□□ -2.11
TSR3Q12094 DNF3YMR162C 4971 nt1.87□□□□□ -2.11
TSR3Q12094 FAB1YFR019W 6837 nt1.87□□□□□ -2.11
TSR3Q12094 THO2YNL139C 4794 nt1.83□□□□□ -2.12
TSR3Q12094 IRA1YBR140C 9279 nt1.78□□□□□ -2.12
TSR3Q12094 VPS15YBR097W 4365 nt1.77□□□□□ -2.13
TSR3Q12094 BRR2YER172C 6492 nt1.77□□□□□ -2.13
TSR3Q12094 FIG2YCR089W 4830 nt1.76□□□□□ -2.13
TSR3Q12094 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.75□□□□□ -2.13
TSR3Q12094 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt1.74□□□□□ -2.13
TSR3Q12094 ESP1YGR098C 4893 nt1.74□□□□□ -2.13
TSR3Q12094 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.71□□□□□ -2.14
TSR3Q12094 SCC2YDR180W 4482 nt1.7□□□□□ -2.14
TSR3Q12094 MEC1YBR136W 7107 nt1.67□□□□□ -2.14
TSR3Q12094 FMP27YLR454W 7887 nt1.67□□□□□ -2.14
TSR3Q12094 MYO1YHR023W 5787 nt1.66□□□□□ -2.14
TSR3Q12094 PAU24YBR301W 363 nt1.66□□□□□ -2.14
TSR3Q12094 RKR1YMR247C 4689 nt1.65□□□□□ -2.14
TSR3Q12094 snR6snR6 112 nt1.63□□□□□ -2.15
TSR3Q12094 IML1YJR138W 4755 nt1.61□□□□□ -2.15
TSR3Q12094 BEM2YER155C 6504 nt1.61□□□□□ -2.15
TSR3Q12094 MLP1YKR095W 5628 nt1.61□□□□□ -2.15
TSR3Q12094 CCH1YGR217W 6120 nt1.6□□□□□ -2.15
TSR3Q12094 IQG1YPL242C 4488 nt1.53□□□□□ -2.16
TSR3Q12094 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.5□□□□□ -2.17
TSR3Q12094 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.5□□□□□ -2.17
TSR3Q12094 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.5□□□□□ -2.17
TSR3Q12094 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.5□□□□□ -2.17
TSR3Q12094 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.5□□□□□ -2.17
TSR3Q12094 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.5□□□□□ -2.17
TSR3Q12094 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.5□□□□□ -2.17
TSR3Q12094 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.5□□□□□ -2.17
TSR3Q12094 DOP1YDR141C 5097 nt1.44□□□□□ -2.18
TSR3Q12094 PAU9YBL108C-A 129 nt1.42□□□□□ -2.18
TSR3Q12094 snR73snR73 106 nt1.41□□□□□ -2.18
TSR3Q12094 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt1.33□□□□□ -2.2
TSR3Q12094 UTP20YBL004W 7482 nt1.26□□□□□ -2.21
TSR3Q12094 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.24□□□□□ -2.21
TSR3Q12094 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.24□□□□□ -2.21
TSR3Q12094 snR161snR161 161 nt1.2□□□□□ -2.22
TSR3Q12094 snR128snR128 126 nt1.03□□□□□ -2.24
TSR3Q12094 UTP10YJL109C 5310 nt1.03□□□□□ -2.24
TSR3Q12094 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt1.02□□□□□ -2.25
TSR3Q12094 URB1YKL014C 5295 nt0.96□□□□□ -2.26
TSR3Q12094 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.94□□□□□ -2.26
TSR3Q12094 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.94□□□□□ -2.26
TSR3Q12094 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
TSR3Q12094 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.94□□□□□ -2.26
TSR3Q12094 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
TSR3Q12094 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.84□□□□□ -2.27
TSR3Q12094 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.81□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.81□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.81□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.81□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 snR87snR87 109 nt0.78□□□□□ -2.28
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