Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGEF1BQ0VAM2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms