Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms