Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP4Q07065 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms