Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EXOSC9Q06265 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC9Q06265 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.7 ms