Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN11Q06124 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms