Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELAQ04206 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELAQ04206 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RELAQ04206 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RELAQ04206 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RELAQ04206 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RELAQ04206 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms