Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAV1Q03135 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms