Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUCB1Q02818 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms