Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCNT1Q02742 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCNT1Q02742 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GCNT1Q02742 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GCNT1Q02742 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GCNT1Q02742 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GCNT1Q02742 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCNT1Q02742 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCNT1Q02742 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCNT1Q02742 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNT1Q02742 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNT1Q02742 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms