Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NHLH2Q02577 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms